Fonksiyonel tıpta muayene önce hastanın anamnez bulgularıyla başlar. Anamnez dediğimiz kısımda hastanın doğumundan itibaren, hatta hastanın anne karnındaki sürece kadar inen tüm özel bilgilerin kaydedilmesiyle devam eden, hastaya ait bilgilerin, hastalık bilgilerinin, sağlık bilgilerinin, yaşadığı ortamdan tutun da hastanın sağlığını etkileyebilecek bütün bilgilerin toplanmasıyla başlar. Ve daha sonra hastanın muayenesi, laboratuvar bulguları ve gerekirse radyolojik bulgularla devam eden uzun bir süreçtir. Dolayısıyla fonksiyonel tıp muyanesi detay gerektirir, tecrübe gerektirir ve zaman gerektirir.